从档案备份保护用途的角度考虑，纸质档案数字化注重数字化成果的图像品质，图像必须清晰、分辨率高，档案存储托管公司，能够保持档案的原貌，但是图像品质越高，相对应的文件存储容量肯定也越大。从利用用途的角度考虑，纸质档案数字化注重数字化成果的利用效率，图像文件不宜过大，否则影响网络传输时间和调用速度。这两种不同的用途对档案数字化的要求也会有所不同，在实际操作中，我们可以对数字化成果采取两种不同的文件存储格式同时进行保存，一种备份用途，一种利用用途，备份用途的采用大文件存储，利用用途的采用小文件存储。
正是由于纸质档案的存储比任何一种载体都有高要求。由于一些年份较长纸质档案长时间缺乏得当的管理和保护，受到自然灾害或使用不当而造成不同程度的损坏，造成无法弥补的后果。同时还会受到外界环境的种种---，例如:
(1)库房温湿度。在档案保护制度中，着重强调对库房温湿度进行监控。因为库房温湿度的调节直接影响到虫害和霉菌的产生，由于空气中含有水分，容易滋生各种霉菌，而档案的制成材料本身就是霉菌生长的营养物，北京档案存储托管，霉菌的生长率就会迅速，档案存储托管系统，在极短的时间内侵蚀纸质档案实体，霉菌在吸取纸张养分的同时还会分泌有机酸，从而增加纸张的含酸量，促使其快速老化。
(2)人为利用。影响纸质档案寿命的因素一是人为利用而间接对纸质档案造成破坏。档案利用者在查找数据、图纸等重要资料时会不经意地因火种(烟头)、油墨、茶水等对纸质档案造成物质沾染。因素二是一些利用者因工作关系的原因，将纸质文件使用复印、拷贝，档案存储托管方案，由于复印过程中产生不稳的因素，致使文件字迹油墨脱落，间接性地造成文件的破坏。因素三是利用者在存放文件资料时，由于包装在文件上面的胶片长期与文件压实在一起，导致胶片等材质产生静电而致字迹完全剥落消失等等，对纸质档案的影响十分不利。
总的来说，档案存储保护工作是从档案入库以后就必须进行的，入库之前基本上不用对其进行技术的保护，也就是说重点在于对档案存储的保护和管理。
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